Using R to process Plate Data

R is good for reading, processing, and re-arranging data from 96 or 384 well plates. Often plate readers generate data which resembles the following:

Example

[Plate: M 410  #1]
Time=00:00:00
;1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12
A;0.125;0.123;0.145;0.148;0.138;0.146;0.145;0.150;0.049;0.050;0.050;0.052
B;0.124;0.123;0.144;0.147;0.137;0.147;0.146;0.147;0.050;0.051;0.050;0.051
C;0.123;0.122;0.145;0.145;0.137;0.147;0.147;0.148;0.050;0.051;0.052;0.051
D;0.123;0.123;0.149;0.150;0.137;0.148;0.146;0.147;0.050;0.050;0.051;0.050
E;0.123;0.123;0.145;0.147;0.137;0.148;0.148;0.147;0.050;0.050;0.051;0.051
F;0.123;0.123;0.148;0.149;0.140;0.148;0.148;0.149;0.049;0.051;0.050;0.050
G;0.123;0.123;0.143;0.150;0.139;0.149;0.149;0.150;0.051;0.051;0.050;0.051
H;0.125;0.123;0.146;0.152;0.140;0.151;0.150;0.154;0.050;0.051;0.050;0.051

[Plate: M 410  #2]
Time=00:01:00
;1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12
A;0.125;0.123;0.174;0.176;0.154;0.174;0.173;0.178;0.050;0.050;0.050;0.052
B;0.124;0.123;0.172;0.174;0.153;0.173;0.172;0.176;0.051;0.051;0.050;0.052
C;0.124;0.123;0.174;0.171;0.151;0.172;0.172;0.176;0.050;0.051;0.052;0.051
D;0.124;0.124;0.180;0.179;0.152;0.173;0.172;0.175;0.050;0.051;0.051;0.051
E;0.124;0.124;0.175;0.175;0.153;0.173;0.174;0.174;0.051;0.051;0.051;0.051
F;0.123;0.124;0.178;0.178;0.156;0.174;0.173;0.177;0.050;0.051;0.050;0.051
G;0.123;0.124;0.170;0.178;0.156;0.175;0.176;0.178;0.051;0.051;0.050;0.051
H;0.125;0.124;0.175;0.181;0.157;0.179;0.177;0.184;0.050;0.051;0.050;0.051

[...] etc.